BYKdb

Dataset for cluster orphancd of phylum bdellovibrionota

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
m-------------------------------------------------------------------------------
-tsedperypygenekpkvtlrderrqdryvtpamvrtsanrypgasyygygysyssirseralkeylgvvfryykmmym
kskt  dkvkvr   rkt     selrrswls vaphrlpsflt  el  wdt d  ghgvssisdvweilvthrtliil
enps  sasvtt   h q     rnkkqktha     pe  ah    g    d       rmpfrtiprsirlrkryfaf
 kgr  qtrsm    g l     hlhgnfd                              kki qffinf lkqwlv  a
 geq  plqnd    e e     d eeee                               hig l afl  k k af   
 eah  hhni                 aa                               dfd h      e        
   d  a k                                                                       
   a    g                                                                       
                                                                                

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
----------------------y---------------------------------------------------------
ivalvllgtllgtyqhflyppl-rasstirvgtyvppltgpsvvnlreeettspnylntqqifggllssstradsylryl
vlgitvvtivialiltsytfrvfetkamvyiqspssvteavtitgvf sqsnegdrrynvrv  yevtryrmitrvvnhs
tivvstssmivfk aslrnvit vsrgvlv sqiqqqid dqasa      k avlmql lm  ryprhvelvrkaihs 
m imfsialgf    ahkkt s tgq r n epgkk    a sp          eiilg hl  qkgkeldimee   k 
f   amf         dfil e k h i f  neeg       e             e   g  pad afae      e 
     aa           g          d  e d        d             a   f  a    a d        
                  a                        a                                    
                                                                                
                                                                                

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
---------------------------------------------------------------------------l----
avsdtfllvvaenlkfsaslelleenlttpkkvsklsrqywkrylthvihknvsvptelskkskydtpvetlvgy-nswv
 qresifyti qhieiygyftsg  spssrstpwnfllkf gnki      apnlewlqevn tvyvsstrirskmkrvi
 n  r ysq  hrqgkitqsppi  lirk eek l kge   hff       dkd rdppqh pstqhignviqf tptl
 k  p  rn  aqpd gef fkd  eaig dda c                     g k fe mrpl hdl eaa snl 
 e  d   e   ke  f a dha  d ed a                         d i e  imli   i d   al  
                d   ag      a                           a   d  elif   e      h  
                                                                i     a         
                                                                                
                                                                                

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
------------i-------------an--a------------------------------------e---------n-i
sfesdgntslve-vvttldsytsali--ah-eefvdlvrerrteevvevveflrekieeatdrvktl-rkliefkek-s-
kytpifrsdgivltaqsttpvwaqkltdvisdayihwsqrssvsaatvnlayvttryvdveskmrqstqrmyryakehnl
evrtvsdnqf t qfnasrarmtmiv  ty nsirtsttqqeslqrsster isqqvtatrkslmladlqivqlqvsyrg
 tdklr mn  r n k enrkl kr   lv klaaqmis ndqi lqrlqk  qk ls sieniek  kerlkheqlrh 
   h d ae  m k      e       e   d     n l lg inka d  h  kk l aaaae  ed fde n  a 
           f h      d                   k id  ki     e  ga i     d  aa a        
             f      a                         e                  a              
                                                                                
                                                                                

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
va----------a-----l---l--a--q--enek-l-------------------------------------------
--vdanttittt-qklsq-etq-te-tv-rs----l-ryyrksrstslvagfdsgsqntsmtldsttwtlrdrlsklaql
tstnsdqneqafssryqsinslvstvileyiqanriynrlssqnrnygsrmtsm a annlaavesgrsvt   tdivkq
lvstqtikv  n rltknnvqrieqlsakqasy geteeflrnmpgtdrnlmqa         gdqsqrmq   kqektf
itlsnqgis  m nhmhk ink nn ri lt   ariskskeelkerrnkdik           ahipnil   ie ie 
g aekkedg  l d feg  eg kg nf ke    m dfihda a q lg ae            g ml e   g  gd 
a   g aaa  i a  ae  a   d k  i         a a    a g                  gi        d  
                 d      a                       a                               
                                                                                
                                                                                

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
--------------------------------------------------------------------------i--l--
kaeyslllrqfytnrsyprlvqikaqidrlnealrdqrreavrsgsganvlaapssertdvqpiearktniser-ke-ka
erqrqvysekl r erhwqiqelrsdvstsvrvvsryg   qan     s     r qgsrerkqi ll    kvedaed
r kknrmrqri p sqsskvkvvnkslqqisnsiqgtn                   iagsdiekf df     mvgstr
  deeg kk g n pnn fmpsmdik eghrar kenm                      mtg     e     asmkrn
    de ia e k ded e eg  ee aeak l gama                      lsa            r fqi
     d f    g  d        d   a e e   l                        n             d  ne
                                                                           a    
                                                                                
                                                                                

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                     .                                          
kn-a---re--l--elkkl-----slpkvqqeynrlqrqvelsyellqnl-kklkeaeiq-es-qktvrlid-a--ps-p
--r-lea--st-qn--e--rskffetsrrevq-fqtnqenqsyrsv----qrr--d---nv--n---i-i-qk-vv--s-
ayqesaqeiasikeqf-qqkkrtdasaelklgrdlfkkrlkaekgsyssvl--ys-lvl-ragdvsn-s-v-fsrpatpt
rsyviytqqry rtlrdraetqqstqgshtt-q-v ennqttaeknqeeikqqtdrisvskv ttgk vvlsy ylggah
nan aqlkkqr lqaitnytrellpmfparrslvp t kfgmqv iftl eeesqqtr aaq rses tndnr st kyy
  k  de  nn ek aghtqn iili aplikhti r aed lq avlk v  mf sm  ik qkde nae p qs dvs
  h   d  kl  h   g lg egk   kd hfmd g     d    ka s  ee  l  ei mgad l   m ie am 
  e      gf  d   e he de       daa  d                    a   f if   f   l fa  h 
                    d aa                                       ha       a d     
                                                                                

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
-rpnk-lkllfg-llglflgvalaflleyldptirs-edleda-gipvlgvvp-fsk-l------gkrsk----------
s----v------m---a-f--------d---n-vktv------t-------i-s-e-e-sitsvv-----nsagsvekql
pyvkltvnvwislvfv-v-ativslvf-lhw-s---rdavqeclrfsfm i- yv-rdq    iftlvkpkms   sats
isssekatiivtcfssvm  lgyvytsswf trl rpt iytvvyvnyi el wmkttk      sestdtln   rrsi
atkrrfslgmt viaail  ivaivimrs  rv  nls  trr qthsf w  rl sns      lhqrvpem   qfne
rqigisni  s tg  gg  gm  tgini   a  gkq  sqn nleq  l  qi nkd      kflqsh     pdm 
nkg fikf  n i    a   l  ma  h       ga  anl hadn  a  k  lia      i kh g     f k 
          g a               f       a       a  l     f   f       e ag e     a g 
                                                     e   a       a              
                                                     d                          

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                   .      :  : . :             .
-------------------------------------vs-p-plvfrsnpeS-leseafrylrariessm--aggppkvi
tqsgnstepeqidietsqvlessssqsaealkvptvn--sdskillvnavtdpvaamsyksilttltlinlkq-nsaqtl
  p  ksvvvdkavknkfsnpdpmylltqvgrs   dsgg-evvicsgqtd lsplnr fiv vqmlyr-yahpetyhsv
  k   nstts  q rdeemkelkvkhs rep     rpysvsnttndesy  r   h  am  k rrmvevdk-rtrrf
  g    r p   l   d kd  hidad  ae     ldtktmfpslyrir  k      t   a qklrdrreknsgk 
  a              a     g             fakgql  pkfdam  i      n   g k kq eedieq f 
                                     d aapi  iia  k  g      k     i al    hdh   
                                         ng  ah   f  e               e    dac   
                                         ke   f      a               a          
                                          d   d                                 

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ::*    :**:    *:*  :.      :.:::* *:* .     :       *. . :                  : 
lvtSaqsgeGKttvsvNLAaslaq-lgk-ktlliDcDlRrPsvhsyFglt-qtpGlvdvltgratleevirkd-vipnld
tis gvpsd  sflai i iafssdtrgvrvvvv a f mativrhlnsprnsa vaeyiemlssirdlvi-spgvervt
a   saqq    vsva   rtigt pne   iim g   k nqstf tfstgqy ftslfadgkpfdsilvpv qlvgis
    pnkn     ics   vc  r mka     l     v rlqpv kqnlars ms f vaetvvnrnylst ltqt n
     lhd     t c     m aar           q eanni dgmkrkq    c nrqqnkkp etnp kfkd h
     ga                i   d           n a mk   ek ehl    a kfplgag   ken ieh  f
                                       l   ge    h dfk      i nhe f    dg ddd   
                                            d    g  ee      g kea      c        
                                            a    e          d                   
                                                 d                              

       810       820       830       840       850       860       870       880
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
.: ..     .   :       :   :   :  ::.* .*         :    .   ..     *           :  
vlpaGtpvenpaellssrkmrsllehlreqydyiivDspPvlpvvdslilsrlvdgvilVvrsgkTpkkavkda-vrllq
iitsdsipsdstraigrpgfllfidemkkefrmvvi ta iglcteavlvasisslyviassart errvles-yndvv-
lflrytpk vqi rqeetavmmrafsay qi  l c  aqaislpavmeqya ttlaqynr tselaaktvekirs
f    fmsmi sah edqslpr chs gts nh  f g  tnvaa gtri hv  ssaikgwe sqsimyrgkth kn
     wkli  p   t nrimn  ar asn ef       lit p  ih   t  fp g f v rapqivh shg ik
      gi       d ldckk   l  nl           ff    ee   h  eg       s l lm se mge hd
      dg         k  ge   k  gk           ae         f  a          d dd q  hda   
      c          d   a      di                                      a  f  a     
                 a           h                                                  
                             d                                                  

       890       900       910       920       930       940       950       960
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
        . *    *                                                                
vg--a--rilG-vv-Ndanasssyyy------yygyyy---gyy------n-----------------------------
-shgykskvy alll nvevthniwklksgygslnrs-gyysshrqantk-shsgnatsrrrrgsvrsgsqrekkrsfsf
sy  qs nfi  iiv rtddrygdlh      ngyspg hr-ptqtgdngal   y nrak  pkrtgde      d e 
lr  nq slv  ttm klvtqv-svv      mfvkar r i rdsrvk y    v       aeqspaa          
fq  kd a f  c   gfsrmryris      f sh m l d dtrmrh v    q         h              
 a  f    a      ecrqknlqgq      d kd l g a aspepe e    l         g              
    e             klagkp p        a         pndid      k                        
                  if eeh l                  nh ha                               
                  a  d   g                   g                                  
                                             e                                  

       970       980     
....:....|....:....|....:
                         
-------------------angktg
nrrkgnpeqpsapitsqsgqkslss
f    psnnd qktq sdaphrsrk
     kqkl  kssl krvk-drve
     ekak  eirk int-qyqlv
     dg g  ddfg eksypkmkn
      d d    af  hkllahad
        a     a   i d g  
                  e   a  
                         
© 1998-2024Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice