BYKdb

Dataset for cluster tadcd of phylum bacteria-division-ksb1

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*                                        . :  :                     . : :   :   
Mee--f---------------------eer-qldltdylrilyrgrWiilisflavmiptlyytfttkPvyeasakimfk
 dnetlsnffedpsmngsatpyrdqqeqgqqkvsiqrfiqafrkrkylliaitvvivaiwailvkqeptlfqstvtvrve
 kddkk  altqynge hmngm isnqnns gipfnklvkvif sw vwalcaalflvsvvffnmkav i r qtlliir
 na  v  ysvfted   leaf gggmiie tttwai wsgml  mvsvtiitaflgstlislsqt t s nsr llq
 gs  n  qkrn d     a a tlel-dt sfrvre mdmvk  aattvg i agfiivwgyrmr q   dcm syd
 qq  h  ngqm           peavhan rsqmk  f   w  f gsa  g sflgg miwnvq e   a v q v
 yl  -  dpnk           lpttsql phv g             ff     ttaas  ahhyi s     s v l
 st  y  vdgi           ensnrpk e g s                    i v f    fse         t  
 pm  i  m fg            ifgfki   e y                             a d            
 mi     l               fdda g     m                                            
  g     g                 a        i                                            
                                                                                
                                                                                

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                             : .: :       :                                     
eesgv---lfd---f-qket-minnqveilksRtlAetvvrrLglseyad----qlellrrh-k------f---s-----
tqgsmeqt---vgs-m-qvsllmstriqeitgksfvkktiakvqktpimeqeteeesipgpnppeakkkv-sql-ttynp
nkdniglsilnitgyikpkg knqriltvfrahaispenaqsmmealelnays sfppiinq adsvsarsgrfasatd 
dinadqrpmielmpmwnnav rveymryq n  lm dqited lqvvtrlsgn kdrffqvg rplghgimnlkkysht 
sy-rsssqgegasatkttrq tltskqst q  n   a msq rnqsqqkpdi hnkvmnkl qhndr kaeii kmgs 
vnk-rakev  srrnsysqn faledmlr g  i   r lne iddml-hk d niqy kae itgae ewap  dle  
qfemqtgvf  fkqlfvmpk e vdaf l        n  ka ea gfvt    -gim hta nyetd arqm  gi   
mvall tf   gfngrgr d a a  e          h  tn st tvks    d dh est en q  spmk   f   
 r de pd   e kapfe a                 y  h  pp qk r    a a  lgs dg l  qg h       
 d    m      d ged                   s     f  ih q          er v  e  nd f       
 a    h        aa                    m     a  da g           p s     g  d       
      d                              d        a  a             h     d  a       
      a                                                                         

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
------l---------lfg-------------------------------------------------fevkp-f-ddvv
isgryl-rfpgdgvfs---lnepldkaperplvsgdvsraisdtisvngfsfraeddtgsqklpsrie-reltklrrria
rpkkwvagvkdt qitwlqidsedsdv pilvrtdslfkiadqlydy  ir slappe ilreretvtvvles vdnyts
vareiinsiyp  tcmvamypn eanl fvt y lh ttfkys va   ly qityn  vvnf qkqpsthvn y etli
 v sfmka fn  y emykv r    g  tr d  f dn v    f      kdnge  yrvr peehpmpie r tsf 
 t qvffe        isye k    e  ek       d             tyde   qtt  dgswnliad i kna 
   dttv         fiv  g                              evr    lsq  rypsikdrk e qkr 
   tlks         a r  v                              nsh    hpi  lvmradspi    gq 
   ga m           d  d                              lr     ang   qlvlarng    ay 
      i              a                              hk      ge   mgqk qya    lk 
      g                                             ae      e    ldng nql    f  
                                                            a    aaf  gf     e  
                                                                      ad        

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  .                .: :      .       :         .               . .:     .    :  
rsl-rg-risvtpirdtd-mieikvtansPfeaafiaNtlaeayvelnremsqgevrqvknfleeQlqviqqqlaeseea
eefmqekslkiefnqsgtylmkvslqdedselvmylteavvqvfsrksqaenrakitkqrevvqnrvsiakenydkanqe
sni pqgqvtprlvpnln illlraksyt qvstqmvdsytkliqdrdklfgkesdsdyldtirdemkqyersmrtiddr
dtv mn ymqaghkntsg v w tyshsn ya ktts qimvi inq vvvtlkmtknmvqisks  rnkrke kv qiq
qh  kk aevsav-kgae f s amvgr  ss ylv  rw ts rqe lftkasgsellttl ng  gkfadd sh  lm
nq  es v n knti      t vfi h  vi si   k  nm kki tssesl eqeiskh  q  dsv vk ed  yk
gk   r t g y s       q i g a  t  cv   v  rq e y mqn  d a tggs   k  nl  t  qa  
yd   h n r s q       n   e t  r   r   n  lh y w irq      s al      at  s  ns  
vv     l i n l       m     p  n   n   m  fe a m anl      r  i      t   n  gr  
tl     k e l g       d     g  i   k   l  d       dk      g  a      e   a   q    
ai     e d d         a     v      e                                             
 g     d                   q      a                                             
                           k                                                    

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                       .    .                                                   
lkefke-rekvvalsneteelvrklaefEslynealtdleslkerleyid---k--qlgenksnfdi-en------i---
yrsyqqanagimsgddraqqtikqivdargeietlkaernanrqlyrrlntinqgetfektrqal--eairyiyrqvarh
wtrarr sq-gitipqqynvnlnessqlnnklrstvqqidgaektqkfae   e  nqddr-k-iel dassvfkglvnl
evt lk khtpnv tttvkgmsermttyhkarkgsrlnfqtyql kdkvk   s  kvq-st-tsqr stad  hedpq 
 sd ta gssftd ghdssnvqsnken  tvhqviqewyrrssr iaq r   r  epvrqvggvnm nlt     tlk 
 qn s  enntsq eeaitkyda  nk  am hknnisqk tnm ftn a   g  vkaslnedglt -sn     s e 
 lk m  dldlal  a nm-k t      vi sa sdans qla aqi t   n  sitqkats-va qv      q   
  h    tka y   s  lsi q      lf f  i  ka ky   na q   a  l sliqrrngv hr      m   
  a    q   l   r  d   i      i  d  h     f    l      p  h ppglp mas  p      k   
       l       k      g                  e    v      d     iedl a p  g      e   
       a       g                              s            ad     e             
                                              i                                 
                                              h                                 

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
              .                                                                 
---sstpyleelkqqladleskraaylaql------g---es----dpdlqeldeqikalkeqlkee--k-aa-------
plfqasslmdiaqkeigekqqqldnlqrntkasinq-vytdnkkhtnsevvkienrleqitkkird-vk-l--qagydmv
si indasivvfrrkmsrsltryvlemtyg   vqnslsdpdg  yhqrirayndevdrvqqrfqtdlaqvtkgsrsg l
qa dvntnfqgvstrqvqyigekttqi-s-   apk yls-t   qyrqfknfrskttltnntyis itsfls eqms f
   lqhvftlqptgnftntdamissfvsrv   mds saryr   dletsireqadqaf ylsvta tqaiil t lq w
   akakaagkile  lif rdarqvtv-k   lte r nvk    -dmmeqtar asv eae nk slrnvv q ap t
   -tq w ks fd  caa ea nvikqai   gsv q eqi    qvnaasrtg  ns rsd yq kvhh t n  t i
   vd  v al  a      d   ehskks   elr n vn-    etl nlmsk  gg hr  v  fr a i i  n s
   t   i sa             d r gm    ei f pgf     nk l k    vt fd  e  am   e g  e p
   p                    r a          a aae     m         in d   d         v  a m
   e                    k                a     k         hm a             l    a
                        i                      a          h                     
                        f                                                       

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                  *          .                . 
--dp--ls--l---kieveaelqalqpkvaa----lkkivdqynakLeslPekslklarLeraakvdekiylmlkekyee
tl--va--se-ftr--tartnietykaeletvqqlqgrelaelsrqmkkv aqesryvertqskqlnsdlfismqaqlqk
 vg lsvqqnmlqsifslkkkvrsvyqrids    arevisdhrleagti deknqmlg qkevtqarnylstvlqsfsg
 in akqyetiveksllidvrnknnteqesr    yestttnmkkr dmh svqathwn sekwetkqettqlqstrrk 
 mr mqpidsyiaevvagvytrsqclkaark    mqqsarltdyd nr  qrt eetd k qrdnlnq wmnfrr nd 
 ha intnrq ysql -ttrsfgeaer ttd    fnnqmnsrags sv  n g v ia v dnseeda  n  tn k  
 g  ywmhtv mmna vs nd tf a  sqe     dgk qm tqn qg  l v l e  i ter      e  nk a  
 s  srig r  l   m  i  d  s  nl       ta kk l l  e    r m    a r m      y  e     
 n  qihd k  k   i  g     i  kk       h  eg e    a    l        n l      t        
 e  egfa d  g            d           d   a           a                 g        
 a       a  d                        a                                          
                                                                                
                                                                                

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  :              ::: *     *             . .  ...   .  : .: :.    :  .      .:. 
srIte----vgqlgdvriidpAkppeePispkkklnlilgillglglGiglaflleylDnsvrtvedv-er-lglpvlgs
akmsvalqnasrteqisvlet ienky vnrnrrqkaviamifsflfsvfvvvfidfmnktlkspdeigkkymkqsliat
lqlar    tvdisnyemv r easif lkgrivmyiltfgvvavfv laitiamnmi raiskmv dgniqvniv a
te ra    stkkyk t   a vldsk yrsd  aimav afi gsi msag vf av d mmaiq  htrnitm  v
ga qs    gqvste q   y qi da fgmq  v fmg vma  v  fm s tr lf t fh ah    yktrm f  i
 nm     esvrs n   q lv yt  l s  t  fa t g  m       mk s       t     tc h      
 k      aemal     k ts vi    g  n     l                     g     n  e      
            e g       rr qv    a  k     f                     e     i         
            a          k ns       i     c                             a         
                         lr                                                     
                         gd                                                     
                                                                                
                                                                                

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
:* :                                            ::          * :                :
IPvikfdeayerl-----------------------qdteeakriaarlithfapksPisEAYRslRTniqyskidkplk
v lveeeqynkl-kklpngatngvhhglmngsvsaklnddkvrlmdsqmvsylysptyvg sfstf--sllfthltgriq
m kldpkkvlgkirvskkssp  asnngkkknai nkesndiqqvstkimkrdraydmyf d qa-qrk-mlarverevr
l q stghtiafwaiqggnrm      ativk h sgtnlasnkteqt laqvkl  lla    yv lqv---qsantkh
  d nlngsvravwsia  hl       s qa   q-seg qgtlte    lnd    e     ii  -fs nnp-tnq 
  t ysqdl-s-ktanl   h       l      iikaa ghsynn     ys                  laqyek  
  m tranesqyastgd           g      pe-qp twpfkg     ip                   -tv d  
  h  q tqmnd gr             f      gvrkk lsd i       l                   g-n q  
  f    igfh  em             i      apqvi f a         e                   dr     
  n     kef   l                     nap  e v                              d     
  e     idd   h                     f l  d m                              a     
        fa                            h                                         
                                      g                                         

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 .:. *    :**:     :.   :      .:::* ****   *  :   .  *::  :                    
tllvtSpgPgeGKSttvaNLaitmAQmg-sktlLiDaDLRRpvlHntFkvdkepGlsNvLvgrasieea-iq----e-te
aivis tavkd  tfsasyisvvltrqkdtnvviv t    gmv silglprri fttyvttsvelsdvyvhlfndpvsh
smmfg fnsy    licv  gtaisnhq lr ivm s     si tl sknqkv df askttfaslplk    knpd
if m  am r     fst   qsf ma  ws     g     nq kv nikndk    l mqmlpadqi ys    t ns
vv l  si n      il    ly  t  vp     c     l  rf dte vy    i ineklvpns mr    r ey
      m  a      ti     s  s  n            i  ia qmt tr    c ydtin--at  n    d  n
                          l  i                afr sq    a sanedyn n  a    q  l
                             a                   cq nn      e g -hl    y    h  g
                                                  g he        d v g    v    a  f
                                                  a           k      m        
                                                                c      l        
                                                                a      i        
                                                                                

       810       820       830       840       850       860       870       880
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  :* ::  *     . *:. :      :      :  :::*:**    .*. ::    *.   :               
idNLsvlscGtlpPNPsElLgSsamrrfldelkrrydlvlfDsPPliAvTDavvlgtqvDGvvlvvrsGkTnrdaafray
vpk ylips smirtsa mfatkrlqklieqmrdefeiiii t  insan saiiarrl atiiilkaaqvdkevvrqki
ye  himtg vimnd l ivv lqkketvqdaeqm gv fl a  vmpf  ps msplm  alm iyerhsstnitkksl
ln  f vla atq       t vlftqa kavsel pf       tvi    l vcswi  sfy nst siqigsiqmcf
hk  t     in          tk mdc vkiqsk  y       a      i   qia  ntv   i m kdrnlv gv
    d     q           et gn  tv nad  t              g   ae   ia      t h kgfl  n
    q     d           ns eg  sr  nh  m                   y           r t  ect  m
    k                 hp d   ng  kq                      k           l p  d s  k
    c                 q  a   hf  g                       m           g l    m  h
    a                 d      a                                         e       q
                                                                               a
                                                                                
                                                                                

       890       900       910       920       930       940       950       960
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
         . * ::                                                                 
ellknvkarilGvllNgvqvesmy--gsYyYyy-hy------yyg----k--k---------------------------
tmfqqsptkvi tiiisinidlahyyegnseq-yy-yqyyyy---kdgn-tk-rkkrrsrsrkllskkthpsdqtirwpw
diyrraqstlv avm dakksnf-  sylkd-q qt   qh fstsedgggsslptkq nhsskkq           rst
sqinsmnnhfp smv ntdanyv   kqff kf -n    g  hsqnsksd nsrstk   hrhtk           qqs
q  dhkrin m i   hltpkgl    k      sh        anstep   ttryh   nhshr           aya
n  st s p a     cfgevki    d      r          tknpe   qsivt   k rsy           lkk
m  ek g s         etqvp           k          rgkt    nn ss   i pqm           tev
k  h  e q         ssgrn                      p hq    kg q    g aph           svl
i     c e         rm                         h e        f    a  ef           prf
g                 ll                         e                  dd           kle
a                 h                          a                  aa           ehd
                                                                              gc
                                                                              a 

 
.
 
-
a
s
v
i
t
g
f
c
 
 
 
 
© 1998-2024Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice