BYKdb

Dataset for cluster tadcd of phylum deltaproteobacteria

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*                                                                    :          
Mnen---------------------------------------------------qeeeeihlrdylrvllrrrwtilla
 tqpnpfdpdysdlernelgltkaseppygyyrlpppgyqapedepislyqpwpp-dsqgvdikelwslirkykklviav
 dp-ssg n f               ersr iqraslpp        agreelqls-dkq-lvyqivgivishyvilvii
 s-srny a                  akn apwv tsl          dss vtrq---rn-thvaqt k wwrvfayf
 rrrklw s                  vg    qs qef          arn lnpptrte-fhy ike -  qyst vc
 -dldtv q                  nt    ni ma            nk idmsplnpt fg  e  y  lmra tt
 qytyrt f                  lm    i  e             ld drdrldags -a  d  w   gp  sl
 ktmvqs e                  il    h  d              a amymgp af s   n  t    m  gk
 gsktfm                    ei                         gtffg  e p   h  q    a  f 
 emiqei                    de                         ek aa    e   a  m         
  lgp h                     d                          g       a                
  hei d                                                e                        
   df                                                                           
    a                                                                           

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
           .        :     : .                                             :     
-fl-avlvtvalytftatpiYratstlliekenpqv-llf--eev-a--lds---------sgt------dfyqtqye-i
tlaliivistligslsmkkvfqgsariivnqskanigvgiqiqqlm-dp-ntpfnipggywtsqsqaalgnywnaelkal
 vi vgfagafvwikvvprl etqtkvqfkenpgkl sdln grmll  vemg   nnsrnqfs      epve ykr v
 tg scstaiyfkvyrqv s kskvsmhmhrklsrg fsr  k-ifs  stp     ansgndm      qsid diy t
 sc lamligv fcwqtr r t fiq mlqddgnep tnk  rvanp  isg      difwae      stmr  vt  
 am gsifv t aavlra a l egn e dyvtmsa amv  astev  yqa         lqd      rlll  sq  
 c   lgsl   v syi    d   m   rttrips mtt  skpvt  gyv         yny      l fk  rl  
       pf   s  ic            gppq  r ekp   hgtm  fgq         rer      g dg  pg  
            i  g              mhi  n  fm   geqg  a l         mtp        aa  m   
               f              ige      g   d dd    k         hkl            f   
               e              g a          a       i         g i                
                                                   f         d                  
                                                             a                  
                                                                                

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
         :                                                                      
lkSrtlaerVvkrlkldehpe-flp-------------------------------------------------------
ievksvvrqliekvgmswdvtkyktkgmkfkvldfsstageknpvyriemtgktredtftvkddngnlilegitgwlgqa
fr swfgkkiaqtqnplrsyd k-qpald  l e a p    l s q klpkap   sqe   gepkfvqtsvkqavsnl
aq pansgd nrsmh kkrra rv-l f   i          e   k   k le   e      dddv gsrnstvklky
 t nrmlqw ftned vdnlr -qst                        v ga           s i krlkasrivdr
 n lp  lt  se q tqaeq vwrs                        s qv             g ikdf nqsmsp
 a dn  dm  lh e qptdl ltgq                        q mg                d   l reak
   ak  ae  dd   pmqk  hsnn                        m e                       ma i
    i   a  aa   nhpi  gnhm                        e                            f
                iglg  amae                                                      
                g ga   i d                                                      
                e e    g a                                                      
                a      f                                                        
                       a                                                        

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                         :      
----------l---------------------------d-----ellkdkalvsrll--ggik-ve-pirdsrlvdvsyt
wlkswlkils-fksfhlfgnqpisqlkgkengtvekty-skpls-eeretnvinvfkprsrltaisvvvkntsiirihfk
 vgf   vtlfa   gitk      sspe kas     sgfqitk--plsgaadqir  nsysvtt qgpsgnvanlgvq
 ysw   svgw      ld      pddt epp     peartdpsgvfddilemvi  pnvl mn lqegag fktvam
 way   asdm      nt      apvs ssl     kigeragtss-rs---kyy  kmfe ll synr m  eat e
 ptt   rpki      kr      vgsp ing     etvdppddkevqiyrvf v  tkma  a rs q e  t q d
 mpp   mm        ap      geq          tptmgntyvdte-q ta s  ea r     r m d  s e y
 kng   lk         n      tan          nlslakspr-p-tm qs q   y q     a k    l a v
 i d    g         h      q k          lkqfyernqqipp  mi m   q f       e    i   s
 d      f                k e          ghn m qmplanm  gh f   l              h    
 a                                      e k  khg hl  ag d   h                   
                                          d  aa  gf   e                         
                                                  e                             
                                                                                

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
      :  :    .  :                                                              
stdpvlaakianalaqayieqnlelrleatsqavewldkqldelkkkleeseqalqrykskhgiis-l------ddke--
tpnrersrdvvmtvvevfvdytvdfksgsaeetkvfitsyiedkrgevdaaqen-nqfgedsnvltstssepgqeevqta
akyayf trlsesi st lqlsqstqtrgsrrilt-fndrvtsaqir--r-dtkvle-qrqys-vn pfy    saea  
nns gq qq pdnh ny qafgm-r-fqelqdvis veqk-nkq-a-ytk -kvmht -knrks-a itq    -trs  
daf ag me   gy ks krkvivvv--t-ng-ar -snemkgmennmrs lnd -k r--qdmy- -dl    nnq-  
gy  kd sv   em al  geq-kslyv-yk-srn mq--ag-e egiqg  a- yd lvte-ltq v g    kg-n  
 s  t  kt      ve  valk -aqtmn-tl-d  -tn at- -d l-  -i ma aqs- anp d f    g-sl  
 g  s   a      lc  twih m asdmdke a  kg  -rt s   q  le k-  lrn  fk         snk  
 f  r            kte  k  n   i  -  ge  vqg d   n  i  in  amk   i         lmd  
    q                   h  k      h  a   sn      i  d  e    ea              l   
    d                   d  i      g      ql                 a               a   
                        a                                                       
                                                                                
                                                                                

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
--------nvtaqklselnkqlteaeter-elearyrqire--------------------------k-pdslp--s-il
sgsndraatilvnrmadvsesvvkvrsqlvaa-tllkel-dlskstpkrksagggaenaqddidqar-g---i-atqavm
        klvmknitt-erar---q---s--s-----as-mlr egg                  avmyia-a  e --
        -saig---qt-ar-mdn-lrkmqvrssvqr-qsaen aq                    enfryst  - li
        sd--et w-mkt- aallakvkkeafqtslvkrvkt nn                    deaqdvs  d tv
        qaky-q qskdsv sy ggdmisk kkrdsteqqiq le                    qdlktte  a ms
        d-grte ngi qt n  ava l r  aihnmakinp kd                    tyvvnf   v fk
        aefpsd ma  -n l   ns q i  thgi vagmg                       rvqsh    p  a
           lr  g    m i   m  f    ifea t   a                       gsnle    g   
           gl  e    l d   i  e    eda  n                           armg         
            d  d    k     f  a         g                            pke         
                    e                                               ke          
                                                                    h           
                                                                                

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
-nnpliqglkqryaelevq-lselstkygekhpqvvalksqldsvqarlkeeiqrvi-s-k---------------n-ye
resamv---rakeikayqeryak-lqtftpey-emkraqneietlrkkieq-yekivn-v-isidpvyqdliikla-d--
qd----asi---lvq-qak kqdtake-kdn-qrlrqvegrmaeike--dst-s---kgie               srvq
 -dkvlsqmfsq-tdvltd tmlkrerllkgnek-i-m-q-qgvnerqm-llvdttlqala               tqla
 rgdstvnaatmrd-q-s- r-ga-sdkr-a  aiqtitkn-qa--tlksait-smygemt               refv
 q tg re viti-snklt -r- ql-i-s-  - -k-sakv--tnqavr-dmrnqra eq               hk l
 k sa md tgn sr ikr snv nav yit  y tetr-d vrfhntrqv qnanqt                  ga t
 h r  lt mes rn dia mlt k-i sgl  t ndknv   naa-n ln ak lns                  en s
 g l  kr  de  l  -  iks  ng  fd  s l  hm   i  s  nk  v gmr                  a  n
   i  i    a  h  r  her  i       p d  ad   h     m   g  hl                     k
   e  d          n  e a          l               i      fi                      
                 g  d            d               a      a                       
                                                                                
                                                                                

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                   : : :    .   
---valrresslrqaleqqknealelnekaiqynilkrevetnrelydtllkrmketrvaegmttsnirivdpaevPrsP
dqaslraq----ksqfaryekkvrdmpdlgrelgv-tddsdvtkqi-tsviqkse-agitkalssntvqviergitstas
   -----vntv-gs--gl-tasfn-kqvevd-arvq-vatslakmlenm-esl-qmdlsadvrigl n lnepvl vrn
   nssskraniq-evs--rgqmmkrs-rs--fsqkls--nnaqd-hkl-m--hydls-nsnsqatd t a y ri sg 
   ayekhqqlaek-sqnaqantqaq-ralth e-hrnttk---a  nf fs is vnsermikvd  s   w ta iw 
   rvkgtika ttrmdev --l-- ql--sg -kfnlrk-lvn-  -v  m fr --mmglypli  y   s sr gv 
   mnt naeq snlilvk qs-ss  ksvla ra d le ksen  sg  l -a sta vefnpe  w   q mp et 
   liq   vg phv gt  sgfar  gqtg  l  - k     l  r-  h q  ie  hstgg   k   n kk aq 
   ign   re ldi  s  md  q  ah    k  m       g  iy  g a  ga   qkee   h   k d  ql 
   g     hd  a   k  e       g       a           r  a         iad    d   h    li 
   e     g       i                              d            h a        d    kh 
         f       a                              a                             f 
                                                                                
                                                                                

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
               . . .   .    .    :  :.    :         ..                          
i----kPnkplnlllgllvGlvlgvglaffleylDnTiktpedvkrhlglpylgvvPeissked----------------
vpkhksqktkrtiavaivlsifaslaivvlidhfadsvrsadeaeqvtritvfamifhfdqnalkkleyyrrmlksgatn
y    n rlaqftiisaiaacag isvilgfatm t mtngs isnaihvnspl fvkgltetgsgkg          
f    y spmmdmvk vmi smm gfts yr a  r lqdea ltkysqagita vlederrssnavf          
t    r qvqk vs  fff  lf t am vq v  v f lsr mrawmdk l  l  ssanskqrrttpe          
s    g gmty  g  g t  t  s mf  m s      vqq  qslfss f  i  q pmrgpetkpn           
d    f aari  f       i  a f     r      kh   ngfvn  t  a  d faddkal kl           
a    a   lh                     m      gd   hetqk  n  s  w  yavana  a           
         fg                     f             r e  c     n  vts-d               
                                              k          k  rpls                
                                              i          c  kghi                
                                                         a  i  c                
                                                            f                   
                                                                                

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                        *  :  :  : :         .:.:*     **:    * 
-----------------------enppelithghpksalaEayrtlRTsllfsaadrppksllvtSagpgEGKtttsvNl
ghangygrrrrnprkvmpvgtepsysvdtvvyqasrtivs gfksikvnihlmssnkekqlivis ptqsa  slias t
     nlnpqghg gtk pia  -slipklsanenqptat si gv navm vrpetsvrvvif  tfaq    kvva m
     k agnae  ade avg  vpaasislvhnllgsfr ta vt    r afiknatstf    ssla    isti i
                   ss  ka-lrmeartd tdpic      k tllig-ihi     mngm    flmt e
                   pk  d-q-m afsss s vt       q   ggenf k     fvee    af g a
                   kd  tkrrf  dlar m qp               -hc        m t    v     
                   en  rtnna   gvl g me                 sg         l l    m     
                   ae  prgk    flk   l                  q          i k          
                       nlee    ekg   g                  a          e            
                       ihc      f                                  a            
                       h        e                                               
                                                                                
                                                                                

       810       820       830       840       850       860       870       880
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
.         .:::* *:*..     :             *:                     :  :  *  . :* .::
aiamaqtgarvllvDaDlRrprlHkifgv------s-ntpGlsnllvgdttldeaiqptgipnLdvipsGpiPpNPsELl
gvslstsqvktvii c m kssvyrtlklvvtssnpskdk vteiiteevefesvvhksevegisllta tvaed akii
sttfvsgmqs mvl g f vinskinhgmsdkkknrgr ivtfaadrgdi-dplvresssyffivsc st g  td v
 svygmaekq  m  t   km ea si      e tsv  asy s nagerriqkn-rnnr yymnt al    v  m
 liv lm l      n   mc tq qe      t sna   dv l hssaaq-klhamlyh wt ar rp        
 n i ge e            a  nv dr      n peq   vm i aipywpydid lgqe kf    qn        
 a    c s                s  q      g avm   ra   tcnvvnt -- qekd             
        p                l  n      d  ki        qmattml pt p dc             
        d                   k      a  ih        il pqlg mc k                  
                                      ad        ge   ad  a                    
                                                                                
                                                                                
                                                                                
                                                                                

       890       900       910       920       930       940       950       960
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 :     .:      :  :..*:.*     *   .        :.                  .        * :..   
gSermkklleelrerydriiiDspPvlavtDalvlstsv-dgvilvveagrtpreavrrakeqlksvnapvlGvvlNdvd
htnafrefilavkkkfahvvl aa lggfa svivtkmaenitlmiirsekvtkktlqhmvrtiaqiggriv aiisrkt
t sklaqmmkqhgse hf lf ts itpls vplfarvs saivftmkgsvsridvakdsrnmvqntqvklm c kir
s alairvvdvasqq ey fv    nasai gsa gnq- rqsmv llfrtlqyaminngldrflgshtnfa l gtk
q wt hd  atrqnn  q       mvv    i   -tt gla i asyfnfdvqiflelmsa rklksvpy f egs
e tn tv  tsmeai  m       aqn    a   vll e      wv e sqhs asfiqv daaeis i t   adp
d ri sa  sd  ws  k        nl    m   s-c        tt d hpgl  q sgs sv   d g q   n n
a q  q   rn  t   i        id        qy         dl q  m f  l f p nt       m   m l
  p  l   qk  r   c        f         hr               a e    e n m        i   h g
  k  g   ig  g                      gk                      c l h        g   c e
  h  e   h   d                      ai                          e               
  g  c                               f                                          
  d                                                                             
                                                                                

       970       980       990      1000      1010      1020      1030      1040
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
       *                                                                        
gd-r-sgYy-y-yyryyy---------------yyg------ee--pkk-------------------------------
mnsgres gh-ygsq-r-yggygygygygygyy--syryryesdgege-kgkkipsfrkrkvlkfirfevgdqhptrird
ik a gd rg s---shr   k rk  r    gs -     adg de-sqr ertk vwqtlwrvt        gs g  
lg k at s  vsryr-t              nn e      --  -prpk rqiy sskgqkntp        ee    
fs t yr k  rhqs ss              kg a      kt  ddqgq tlrr lre  eakh              
ar s qe a  q np gg              d  r      ya  stnse s vh tp                     
te q ly    h gn ap                 n      qy  argrd d lg k                      
sy n ka       m  k                 h      pr  qqena   gf a                      
rv m h        k  h                 d      nk  nhah     d                        
pt e d        h                           g    a e     a                        
nq            g                           a      d                              
kh            a                                  a                              
e                                                                               
d                                                                               

      1050      1060      1070 
....:....|....:....|....:....|.
                               
--------------------------skrss
qgssiqdqrvtvskptlqkkmetlsprskka
d ae gk asklpg r         k--eak
         geiaw p         wkr-vr
          aaqe n         tevtrh
               k         qatsfg
               e         ivnm-d
               y         gpiitv
               w         dgevqt
               m         rddgnq
                         a  fh 
                            ag 
                             e 
                               
© 1998-2025Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice