BYKdb

Dataset for cluster tadcd of phylum campylobacterota

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*             ::        : .    *    :.       : :     *     : .                : 
Msnn-i--qv-rndeiDlkeifktirrykfsIifitliftigsavyaYfkpniYsssatievqee-k-k--nt-sadflk
 -keq-yn-qkepnqvtivsviqvlskniyi llvaililsltyifvhtlrsv qaytsvslssqgeartvswntsaamp
 g-- stkk-isdrnm sqqtvnlvnqgrwl fisvfvafmtavtwl vtdyt avtvlmkikgd n -  gngpqsiil
 eqq keinehn-  l  gklwli ln lvf vslsmftaaavsl i lsap  rtfsilammts t q  rylm- vva
 vlt tistnr-v     ed lih th  i  m  i   svv m    ya e  l n    flnn s d  kvslt   s
 tms qafskqvs     at  e  m   k  a      mgi      e     f d     edk q n  arkir    
 qir    pinqe            k                                    d g d m   ldgk    
 ndi     fem             i                                              kaeg    
 m       aaa             f                                              i  d    
 i                       a                                              g       
                                                                        f       
                                                                                

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
             ..     :::  :     . : :    :     .:  *  .     :                    
kaf---ggg-gvnvdneieilksrflaqkalkylnlgtryftkkn-yrkvElyknspfvvttkfl--------ddliygk
qsissltsstvsklekqmlviqtkyiinrvisnvdinvklyitselfktt ffqktdiiisdeyidelyvetmkntlsqy
mqlylkdndmsevikdvkvtfe fkfnetmaefmsvrref veny h ny venfi lk ksivv      iavenarde
eet a -ra earfqtsrtlm   s tdsifdsip kqd  evvv   vr idssa ht niskm        tpmseyt
d      dt ntg nlilq        tl   r   ei   adhs   sn ele    ivnth        sqkf  s
s      an kle  iafd        se   k   d     qeh   ek    g     gqlst        n gm   
a       e fi      a        k    e   a       d    i    d     eldik        g i    
           d                    d                h          dkaa         e d    
                                                 f           g                  
                                                 e                              
                                                                                
                                                                                

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  : : .  .  : :                                    :.. :    : : : :             
-kfqlipiseetFrLtiepsskyslkg-il--lgv------dlisydkvhkygeeiktewfsitvqkis-----------
lrlkittvdknsynikvkqi-i--k--k--ay---qplkay---vsseimsfnktlsipgytlvieqlegveplvdsmes
 fiiv- lnnkk y vkna-l-wk-vshlykltpllsfekvqkld eanka dss deaf nfkln vrerdlfe ai n
 t e e qaddg t yflsrfvs idyevktkikfkkysdsnpfy nylcy  qp qsry emy i nf           
 s n m ktstr k l dgvwpq msr  fst  isavptereet gq  r   d nrql v r h sn           
 n y    g  i i   t  k  rn   ne   r s pref q     e   r vnih   n t  h           
 l           e   g  f  i    e    p   eq   l         k        i d  a           
 i                 a  e       d             i                  h                
 e                                          e                  d                
                                                                                
                                                                                
                                                                                

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                         *                  :     .    :: :   *  . *:    . :   :
------------------yltnp-sYsfsfvhns-slyn-ylsnlsisqvselasilklsfqDtvplRAkeilnalakay
kilnllsisiditssisstsssnvk fqtyiprqaifsdfvypgitvaplnv-gpviritye ntst tfdlvdsifnsf
  hkf hfn  fd p   speeeee yvivsddm gmistirnd nayea nn-tlvlveit ss q  rkyisevvev 
                  qfkmsa- q ytmspv yqeeyfqkt h ttp kftr ms n n rl m   rvae mgyr 
                  nyqkk v h rlfttt taawv ies d ls  dasn  q g y qi k         ttk 
                  kmlhg t e qitrkn l prr fdk    i  ry e  n   l  a i         ss  
                  phd a r   k qnee k lqn kgh       qk        f              lr  
                  e     i        d d   k aa        p                        hd  
                  d              a a   h                                        
                                       d                                        
                                                                                
                                                                                

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
       :       : *:: *:  :.  *.     *: .:                  : .          .   :  :
ieeevkrKseeanltldFiDsQlesinkrLkssetkLesykeknevvnlsekatttakklseyeaklqeiqteinilknl
ldqtleqrtkvlqksie lnt iievkek qktgsq qkfqathnliqpniqskllteqitkldsqvyslsirlreiesf
vaysirl rgsnsqv s   r  da hdv sveans keh qsskiyimegsidavstn vssreensnnnyqesvvdri
rsdkrnd nvk err q   a  ak rat ntk gr  r  vv iatgv-di sqmise ndrqtsiekvdl dtlmsg 
ngvgmds dst g k n   n  sg  tq er  ei  n   d dsmdttsd msivqt g kkirqdi tm yq  aa 
m  dk n  r      g   k  ld  sn  i  dd  v     v fsipq  ln mai e f    nd kf ql     
k     k  h      a        ri  a  l   d     s  m ma  im l   a      h  i  kg     
      e                    qe     k         q  f l   gd                         
                           id               g        a                          
                                                                                
                                                                                
                                                                                

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   :                                 .:  :              .     ::  :         :   
qqyis-----------------------------snqdlsgltv-----gsinf-adpalsslitklqeestqrssLlvd
syfvksnntlntvslsnvgvdtssiqyliesfrstdrnitsiaiqqnsiskvqtqsnqsiaamvnqitdlvlkldtvsie
ldalnrd rissll lst i it  gt  drykrqhhq nemdp lkn dlsil nssqtlt  kn hqaqslkea ktn
iss ln  e      a s   a    s     indsde fsm   d ntmeq vgmpvgq  is rtsnnsavn  lk
fr  v                             nrtk  rl     epavi l kv vn  sr n qekn tl  fg
nn  t                             k s   mf      aqta g d  tl   k maim qe    
kh  r                               l   g            d    ri     ktgh n     
ee  i                               k     e                 ng        ke        
    e                               e                       i          d        
                                                                                
                                                                                
                                                                                

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
:*  **:       :   .  :   :                               :   :          :  :* :.
yTelHPdvvkltktiaslrrsiktalknnlrql----------------------nqrkkslnslirkyksslqsLPkqe
f dq  qilqasqsvstikdrllesisssiysiqssqknakstiltniemvksnlkrktstmkrikseftkmieti eks
  pv  eaqgikeqlrayekk eatvetlknksnrnkelt rk in mlvtrrs esqianitedvlqknri kg  nek
  ar    ievnsn fyt sq rqn tiy krfendiai  a   g      n  vn lrvfrav qgqele al  s d
  ne    e sqnl ers qn iky raa eg                       ga dnl qqs n ns a nk  r  
   d    s qmar dn  hm hiv a   d                        a    e lnr g hh   la  q  
          m  k  k   e dgk     a                             d ig  f        a  
             d  h   a                                          d  e             
                                                                  a             
                                                                                
                                                                                
                                                                                

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
     * :   :.. :* :**:*: *  : . * :.. . :  .      : *:       . ..*  ..:     :  :
keltrLtrhfsvnekiYsfLLeKraEtaIlksStisnsrildealvypipikPkrmlivlvglilGlivGlayaflrefl
rqnse kkdytlssnv ty  q ks nemiqa vvadakviestynpsehva nkgfmliismlv ivlsvlltvikksm
lntqn s smeitm e   k  i  sev k petqlvgqpilqeya r  pkrpivsaiff mtisfiav ymf
qi ik q k v   e  q      m  mr     syhk  d rertt  e   vnl-al f  iqv g nli
it as h y n   d  a         v      kve   t viins      tm     a       i    la 
 k eq   p m                  t       g    p edglr      s                    
        f k                               n   dkq      r                        
          i                               i   agl      q                        
          g                               g     k      n                        
          a                                     h                               
                                                g                               
                                                f                               

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   :.    ::  :  *:** :*                   :  : : :** *          . ::*::  ***:   
nntiknteeiEklssiPiYGviPlnkn-------kktkniflEsfrsirTNLqFlpqse-ssrvititSsvsgEGKttiv
ddkvrgvtdvkrytdl v  il tkssevgievfr--dspysdalkvlwa  e vlnngkkckivlvs tipq   snvs
igr qdsdmsv rv    tv nrdg       -snarliy fy nvg   h aqrhdddantms   ak    ftt
 y  etkk   nr tt    s  fe-i       hiavkfak  i a     a mtken rnqlf            i
 t   saa   mf ka    n  ylvd         stia f    w        ittv q vk               a
 r   en    da          qir          mshk e    i        asqs h ta                
      i              k            irg  d              pg  e                   
                       e            dq   a              g                       
                       d                                                        
                                                                                
                                                                                
                                                                                

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  :.  :     . :::*.*:*.  :       *  *    :     :   :        : .:. *    * : *:.  
anLaeiiaqtnkkvivlDlDmRkpslhkefnlpNniGmsnyLtgqntlee-viqktkdenldvIttGplPPNPSeLilsd
tkigkvlsksdfrtvii f l rskvyqllgvs kv lttliserssihtditnhi-ydfvslfpa simk ltk lmtk
gg ssafqiag nillm v   narmsnkykid tl vggf vykke rn lvkrsentgihi as vv     g vfvn
ce  mgeie            gt  tacdra ak i    innyr nd   spvssph ff  g tt        vme
        rgq                r  ekn ve f    dmhvm l    mglrqk         s         lr
        a                  e    e  a    akgi  k    ie diy                   
                                         ddc       a  ah                      
                                             a           e                      
                                                                                
                                                                                
                                                                                
                                                                                

       810       820       830       840       850       860       870       880
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
     :  *   *:::::*:.* * . *:   :.  *  :   :   : *.::  ::.          *:::*  .    
kfkklikeLkekYdyiiiDtpPvGlVtDalilmnysDisllvvRanytrKefiknldrlakehshnsiGiilNgvkige-
rmedivet lns efvlf sa i sfn smtilkma vnfvlikedfsk syvssinkmvidqhv-ka mvi aselkkk
nltlfldi esr     l  s a m i ttma rlt tv mif vevae d lernfsrmknqkhv l   ktrvsgg
stgtv sr mkq            t a  fl  qhv  t itt ssm y   mtq  hain ydihtf f    inayd 
m drt nn  re                 s        l f l  q          ire ptlgrs        fvs 
i anm al  qd                 n          t a  a                np  np         tr 
h  i   h  lt                            a                      k   m          i 
e  e      gn                                                                    
                                                                                
                                                                                
                                                                                
                                                                                

       890       900       910  
....:....|....:....|....:....|..
     ..:                        
k--ygyGYgys--ygygYgndk----yk--nr
skssahnfsvgsd------as-yyge--dryg
nrggs psv  msts y-nyg   ign rt
t dai    an  dalk syeq    hie ps
q         m   n   kg-     ee  gk
e                  dt         s-
                    g         hh
                              da
                                
                                
                                
                                
© 1998-2025Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice